乙酰化是最早被发现的与转录有关的组蛋白修饰方式。组蛋白末端的乙酰化状态在组蛋白乙酰基转移酶(HATs)和组蛋白去乙酰基酶(HDACs)的作用下保持着动态平衡，并与染色质的转录活性状态密切相关。乙酰化的染色质与转录激活相关，而去乙酰化的染色质与转录抑制相关。