【正确答案】 A

【答案解析】[考点] 登记及其法律效果；善意取得 [解析] 根据《物权法》第19条，由于甲同乙签订过一份《协议》，甲也属于对该房屋的利害关系人。因此，根据该条，如果甲认为该房屋权属登记错误，其有权要求进行更正登记，A正确。甲乙之间合同约定有效，不是借款购房关系。乙是登记名义人，甲为事实物权人，C错误。由于甲与乙之间的合同约定了是由乙代甲购房，该约定合法有效，并不存在法律规定的无效事由。甲可以依据合同约定请求乙过户，B错误。根据《物权法》第106条，善意取得制度以无权处分为前提条件。因为房屋登记在乙名下，乙是房屋所有权人，乙处分房屋属于有权处分，甲不构成善意取得。丙是基于买卖合同取得所有权并不是基于善意取得制度取得所有权，D错误。