【正确答案】 C

【答案解析】[解析] 根据《仲裁法》的有关规定，仲裁协议是仲裁机构对纠纷进行仲裁的先决条件，而仲裁协议是当事人自愿将纠纷提交仲裁机构进行仲裁达成协议的文书。因此当建设工程施工合同双方发生争议，需依法确定仲裁机构时，应选择当事人双方共同协定的仲裁机构。仲裁不实行地域管辖，所以A错误。合同管理机构不会指定仲裁机构，所以D错误。申请人只能是共同协定仲裁机构，而不可能指定，所以B错误。