(1)助消化药中多为酶或活菌制剂，性质不稳定，不耐热或易于吸湿，应置于冷暗处贮存，超过有效期后不得再用，另送服时不宜用热水。 (2)抗菌药可抑制或杀灭助消化药中活菌制剂的活性，使效价降低：吸附剂可吸附药物，降低疗效，如必须合用应间隔2～3小时。 (3)酸和碱均可降低助消化药的效价，服用时禁用酸碱性较强的药物和食物。胃蛋白酶在中性、碱性及强酸性环境中，消化力减弱，在弱酸性环境中，消化力最强。 (4)干酵母和乳酶生的不良反应较少，但不可过量，过量可能发生腹泻；胰酶所致的不良反应偶见腹泻、便秘、恶心及皮疹，其在酸性条件下易被破坏，故须用肠溶衣片，口服时不可嚼碎，应整片吞下，以免药物残留于口腔内，发生严重的的口腔溃疡。 (5)胰酶对急性胰腺炎早期患者禁用，对蛋白质及制剂过敏者禁用：其在酸性环境中活力减弱，忌与稀盐酸等酸性药同服。与阿卡波糖、吡格列酮合用，可降低降糖药的药效；与等量碳酸氢钠同服，可增强疗效；与两咪替丁合用，由于后者抑制胃酸的分泌，增加胃肠的pH值，防止胰酶失活，增强疗效。胃蛋白酶不宜与抗酸药同服。 (6)多潘立酮对乳腺癌、嗜铬细胞瘤、机械性肠梗阻、胃肠道出血者禁用；对心律失常、接受化疗的肿瘤患者、妊娠期妇女慎用；同时在服用期间排便次数可能增加。