以下几种组成呼吸链的氢或电子载体最为重要：烟酰胺腺嘌呤二核苷酸（NAD）和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸 （NADP）；黄素腺嘌呤二核苷酸（FAD）和黄素单核苷酸 （FMN）；铁硫蛋白（FeS）；泛醌辅酶 （Q）；细胞色素系统。