（1）分子的产生角度：

①同：都属于小分子RNA，都需Dicer切割产生。

②异：a．小干扰RNA（siRNA）有时称为短干扰RNA或沉默RNA，是一个长21到25个核苷酸的双股RNA。MicroRNA（miRNA）是一类由内源基因编码的长度约为22个核苷酸的非编码单链RNA分子。

b．产生siRNA仅需一次Dicer切割；典型的miRNA需经过两次切割形成，第一步是释放柄环，由核糖核酸酶Drosha切割初级miRNA，产生前体miRNA，第二步才由Dicer切割前体miRNA生成双链miRNA，双链解链形成成熟的长21nt左右的单链miRNA。注意：植物细胞中miRNA经Dicer切割产生。

c．病毒RNA以及由环境、实验因素引入的外源RNA都可能是siRNA的来源，基因组重复片段、转座子等序列也可能产生siRNA。miRNA由RNA聚合酶Ⅱ转录，并具有自己的启动子区域，它的表达会受到各种时空上的调节。

d．双链siRNA其中一条链为引导链，介导mRNA的降解，另一条链为乘客链，在siRNA形成有功能的复合物前被降解。双链miRNA中哪条链作为miRNA由其5＇端热不稳定性所决定，5＇端相对不稳定的链更有可能成为miRNA。

（2）生物学功能和作用角度

①同：siRNA和miRNA都可以装载在RISC中使互补配对的mRNA降解，介导转录后沉默的发生。

②异：a．siRNA还可通过在染色体水平上形成异染色质介导基因沉默。

b．miRNA-RISC介导的基因沉默还需要一些其他功能保守的元件参与。

c．对于结合蛋白完好的mRNA，如果体内有与它相配对的siRNA，该siRNA便作为扩增的引物以mRNA为模版合成双链RNA，产生新的RISC，新扩增产生的各种次级siRNA可以与靶mRNA的不同区域配对，更大范围的降解靶mRNA。

d．miRNA可抑制mRNA的翻译，降低靶基因的蛋白水平但不影响其mRNA的水平。miRNA介导的翻译抑制可能是通过形成miRNA-mRNA配对分子，阻碍有功能的核糖体与mRNA结合、装配。