【正确答案】 D

【答案解析】[解析] 地方性法规和部门规章之间发生冲突时，由国务院提出意见，国务院认为应当适用地方性法规的，应当决定在该地方适用地方性法规的规定；认为应当适用部门规章的，应当提请全国人大常委会裁决，A项错误。部门规章之间发生冲突时，由国务院进行裁决，B项错误。同一机关制定的新的一般规定和旧的特别规定不一致时，由制定机关裁决，C项错误。行政法规的效力高于地方性法规，D项正确。因此本题正确答案为D项。