(1)疫苗批发企业运输疫苗应使用冷藏设施、设备和冷藏运输工具。故A错误。

(2)疫苗生产企业或者疫苗批发企业应当按照政府采购合同约定，向省级疾病预防控制机构、指定的其他疾病预防控制机构供应第一类疫苗。故B正确。

(3)设区的市级以上疾病预防控制机构不得直接向接种单位供应第二类疫苗。故D错误。

(4)第二类疫苗是指由公民自费并且自愿受种的其他疫苗，故C错误。