【正确答案】克隆载体的进化过程划分为三个阶段： (1)第一阶段包括天然质粒和重组质粒的应用。克隆载体是以质粒、λ噬菌体、柯斯质粒(又称粘粒)为主，包括pSC101(第一代分子克隆载体)、ColE1质粒载体、pBR322质粒载体等，主要特点是载体在宿主细胞内稳定遗传、易分离、转化效率高，但是克隆容量有限，一般小于45kb。 (2)第二阶段的克隆载体主要包括酵母人工染色体(YAC)、细菌人工染色体(BAC)、噬菌体P1克隆系统、由P1发展的PAC载体。通过降低载体的长度使载体的容量增大(可达100～350kb)，并建立多克隆位点和新的遗传标记基因。 (3)第三阶段的克隆载体以双元细菌人工染色体(BIBAC)和可转化人工染色体(TAC)为主，这些载体不仅具有较大的克隆容量，而且具备了直接转化植物进行功能互补实验的功能，推动了结构基因组学和功能基因组学研究。