判断受审核方的管理体系是否符合审核准则的所有要求，管理体系是否得到有效运行，是否有效实施了组织的方针和目标;判断受审核方是否遵守了管理体系的各项程序;确定组织的管理体系是否能够通过现场审核，推荐认证注册。

第二阶段审核应在受审核方的现场收集审核证据，并至少覆盖以下方面：

(1)与适用的管理体系标准，或其他规范性文件所有要求的符合情况及证据；(2)依据关键绩效目标和指标，对绩效进行的监视、测量、报告和评审；(3)受审核方管理体系的能力以及在符合适用法律法规要求和合同要求方面的绩效；(4)受审核方过程的运作控制；(5)内部审核和管理评审；(6)针对受审核方方针的管理职责；(7)规范性要求、方针、绩效目标和指标、适用的法律要求、职责、人员能力、运作、程序、绩效数据和内部审核发现及结论之间的联系