本题考查我国近代教育家的主要贡献。

南京晓庄学院始于1927年3月由陶行知先生创办并任校长的晓庄试验乡村师范图书馆。因此，晓庄学院是陶行知最早创办的学校，A项正确。

B项错误，1939年，陶行知为了收容在战争中流离失所的儿童，培养有特殊才能的儿童，在重庆创办了育才学校。与题干不符，排除。

C、D项错误，1931年春，陶行知返回上海从事科学普及教育，提倡“科学下架运动”，创办“自然科学园”“儿童科学通讯学校”，组织编写《儿童科学丛书》等，进行教育救国和科学救国宣传。自1932年起，陶行知先后创办了“山海工学团”“晨更公学团”“劳工幼儿团”，并首创“小先生制”。与题干不符，排除。

故正确答案为A。