【正确答案】 D

【答案解析】根据小额贷款公司的资金运用，同一借款人的贷款余额不得超过小额贷款公司净资产的10%。在此标准内，可以参考人均GDP水平和小额贷款公司所在地经济状况，制定最高贷款额度限制。根据题意，该小额贷款公司同一借款人的贷款余额不得超过5000×10%=500(万元)。