（1）利用SDS-PAGE从混合蛋白质样品中分离、鉴定出可能存在的蛋白质复合体的方法不可行。
（2）因为SDS-PAGE为SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳，在电泳样品制备过程中需要添加SDS和 巯基乙醇，属于变性电泳。SDS即十二烷基硫酸钠，是一种蛋白质变性剂，它可以破坏蛋 白质分子中的氢键和疏水作用；巯基乙醇是还原剂，可以破坏二硫键。在巯基乙醇存在 下，SDS使蛋白质复合体中的各亚基分离，并且亚基多肽链充分展开，故SDS-PAGE只能 分离蛋白质亚基。
（3）分离蛋白质复合体的生物化学方法有凝胶过滤柱层析、密度梯度超离心等。