永存动脉干又称共同动脉干，是由于胚胎期原始动脉干分隔为主动脉、肺动脉的发育过程中出现障碍，心脏仅发出单一动脉干，此动脉干再发出主动脉、肺动脉和冠状动脉，单一动脉干只有一组动脉瓣，即半月瓣，半月瓣骑跨于室间隔缺损上。主-肺动脉窗与永存动脉干血流动力学相似，但区别在于主-肺动脉窗的两组半月瓣都存在，且室间隔多完整。