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新一代测序平台的优缺点及应用
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| 平台 | 文库/模板准备 | 测序反应 | 读长/base | 测序时间 | 测序通量/Gb | 优点 | 缺点 | 生物学应用 |
| 454GS FLX | 片段化乳胶PCR | 焦磷酸测序 | 330 | 0.35 | 0.45 | 读长较长利于重复片段测定；测序时间较短 | 试剂成本高；测定同多聚串错误率高 | 从头拼装测序；元基因组 |
| Illumina/So lexa"s GA Ⅱ | 片段化桥连PCR | 可逆末端终止 | 75或100 | 4.9 | 18、35 | 目前运用最广的平台 | 样本倍增力低 | 重测序 |
| SOLiD 3 | 片段化乳胶PCR | 连接测序 | 50 | 7、14 | 30、50 | 双碱基编码提供内部纠错机制 | 测序时间长 | 重测序 |
| HeliScope | 片段化单分子 | 可逆末端终止 | 32 | 8 | 37 | 测序模板数量上无偏 | 高错误率 | RNA-seq |
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Pacific
Biosciences |
片段化单分子 | 实时测序 | 964 | N/A | N/A | 读长最长 | 高错误率 | 全长转录组测序 |