本题主要考查前列腺癌的辅助检查及常见检验标志物的意义。

直肠指检、血清前列腺特异性抗原、超声引导下前列腺穿刺是诊断前列腺癌的三个主要方法，确诊依靠直肠超声引导下前列腺穿刺。

A项错误，癌胚抗原脏器特异性较低，主要见于胰腺癌、结肠癌、直肠癌、乳腺癌、胃癌等，用于辅助恶性肿瘤的诊断、判断预后、监测疗效等。

B项错误，酸性磷酸酶主要来源于前列腺、红细胞、血小板，主要用于诊断前列腺癌，但由于其不稳定，检测困难，目前已被前列腺特异抗原所取代。

C项错误，甲胎蛋白是胎儿时期由肝脏和卵黄囊合成，出生后，AFP合成很快收到抑制，升高常见于原发性肝癌、睾丸癌、卵巢癌、畸胎瘤、肝硬化等患者。

D项正确，前列腺特异性抗原由前列腺分泌，升高主要见于前列腺癌，也可以用于前列腺癌术后评估病情，提示肿瘤是否转移或复发。

故此题正确答案为D。