【正确答案】细菌通过对自身DNA上的识别序列进行甲基化来保护自己的：DNA不被限制性内切酶破坏。

【答案解析】[考点]限制性内切酶的来源。限制性内切酶在识别和进行切割时，对DNA的识别没有种属特异性。含有某种限制性内切酶的细胞，要么基因组DNA中不含有该种酶的识别序列，或者通过甲基化酶将甲基转移到识别序列的碱基上，不能被限制性内切酶切割。