本题考查行政法常识。

A项正确，《食品安全法》第一百一十条规定：“县级以上人民政府食品安全监督管理部门履行食品安全监督管理职责，有权采取下列措施，对生产经营者遵守本法的情况进行监督检查：（一）进入生产经营场所实施现场检查；（二）对生产经营的食品、食品添加剂、食品相关产品进行抽样检验；（三）查阅、复制有关合同、票据、账簿以及其他有关资料；（四）查封、扣押有证据证明不符合食品安全标准或者有证据证明存在安全隐患以及用于违法生产经营的食品、食品添加剂、食品相关产品；（五）查封违法从事生产经营活动的场所。”因此，执法人员可以扣押该超市未经检验检疫的生猪肉。

B项错误，根据《行政强制法》第二十三条第一款的规定，该大型连锁超市的总部不属于涉案的场所，不得对其进行查封。

C、D项错误，根据《行政处罚法》第三十三条规定：“违法事实确凿并有法定依据，对公民处以五十元以下、对法人或者其他组织处以一千元以下罚款或者警告的行政处罚的，可以当场作出行政处罚决定。当事人应当依照本法第四十六条、第四十七条、第四十八条的规定履行行政处罚决定。”第四十二条规定：“行政机关作出责令停产停业、吊销许可证或者执照、较大数额罚款等行政处罚决定之前，应当告知当事人有要求举行听证的权利；当事人要求听证的，行政机关应当组织听证。当事人不承担行政机关组织听证的费用。听证依照以下程序组织……”吊销企业营业执照、责令停产停业不得当场做出行政处罚决定，需适用一般处罚程序，并在作出行政处罚决定之前，告知当事人有要求举行听证的权利。

故正确答案为A。