本题考查民法常识。

A项错误，公平原则是民法的基本原则，是指民事主体应依据社会公认的公平观念从事民事活动，以维持当事人之间的利益均衡。具体表现在以下几个方面：民事主体参与民事法律关系的机会平等；当事人的关系上利益应均衡，合理分配义务；当事人合理地承担民事责任。题干中，商家本就知晓“赌石”会存在开出极品玉石的概率，并且李某已经给付商家4000元购买了该原石，双方的买卖合同已经成立，因此，商家不能基于公平原则要求李某给予其适当补偿。

B项错误，《中华人民共和国合同法》第五十四条规定：“下列合同，当事人一方有权请求人民法院或者仲裁机构变更或者撤销：（一）因重大误解订立的；（二）在订立合同时显失公平的。一方以欺诈、胁迫的手段或者乘人之危，使对方在违背真实意思的情况下订立的合同，受损害方有权请求人民法院或者仲裁机构变更或者撤销。当事人请求变更的，人民法院或者仲裁机构不得撤销。”《最高人民法院关于贯彻执行<民法通则>若干问题的意见（修改稿）》第七十一条规定：“行为人因对行为的性质、对方当事人、标的物的品种、质量、规格和数量等的错误认识，使行为的后果与自己的意思相悖，并造成较大损失的，可以认定为重大误解。”题干中，在李某知晓“赌石”活动并且花费4000元购买原石时，买卖双方的合同已经成立，同时双方并没有对原石的品种、质量等产生错误认识，故商家不可基于重大误解而主张撤销交易。

C项错误，《中华人民共和国合同法》第五十四条规定：“下列合同，当事人一方有权请求人民法院或者仲裁机构变更或者撤销：‘（一）因重大误解订立的；（二）在订立合同时显失公平的。一方以欺诈、胁迫的手段或者乘人之危，使对方在违背真实意思的情况下订立的合同，受损害方有权请求人民法院或者仲裁机构变更或者撤销。当事人请求变更的，人民法院或者仲裁机构不得撤销。’”《最高人民法院关于贯彻执行<民法通则>若干问题的意见（修改稿）》第七十二条规定：“一方当事人利用优势或者利用对方没有经验，致使双方的权利与义务明显违反公平、等价有偿原则的，可以认定为显失公平。”题干中，李某与商家的买卖合同是基于公平、等价有偿原则订立的，是有效合同。因此，商家不能基于公平而主张撤销交易。

D项正确，题干中，李某通过与商家基于公平、等价有偿原则订立买卖合同，故该合同有效。因此，商家无权要求李某退货或补交差价。

故正确答案为D。