细菌RNA聚合酶的校正机制分为RNA的编辑、RNA的再编码和RNA的化学修饰。

（1）RNA的编辑

RNA的编辑是某些RNA，特别是mRNA前体的一种加工方式，如插入、删除或取代一些核苷酸残基，导致DNA所编码的遗传信息的改变，因为经过编辑的mRNA序列发生了不同于模板DNA的变化。介导RNA编辑的机制有两种：位点特异性脱氨基作用和引导RNA指导的尿嘧啶插入或删除。

（2）RNA的再编码

mRNA在某些情况下不是以固定的方式被翻译，而可以改变原来的编码信息，以不同的方式进行翻译，把RNA编码和读码方式的改变称为RNA的再编码。某些有机体中进行蛋白质翻译时，mRNA的读码信号在tRNA、rRNA和其他蛋白因子作用下发生＋1/-1移位，甚至发生核糖体跳过50个核苷酸的情况，前两者称为核糖体程序性＋1/-1移位，后者称为核糖体跳跃。

（3）RNA的化学修饰

除了RNA的编辑之外，有些RNA，特别是前体rRNA和tRNA，还可能有特异性化学修饰。仅人细胞内rRNA分子上就存在106种甲基化和95种假尿嘧啶产物。相对分子质量只有70～100个核苷酸的核仁小RNA参与RNA的化学修饰，因为这些RNA能通过碱基配对的方式，把rRNA分子上需要修饰的位点找出来。一般认为，核仁小RNA上的D盒是甲基化酶的识别位点。