【正确答案】 D

【答案解析】第一步：判断题干词语间逻辑关系。
小麦是馒头的原材料，二者是对应关系。
第二步：判断选项词语间逻辑关系。
A 项：麝香的原料来自麝鹿，不是麋鹿，与题干逻辑关系不一致，排除；
B 项：叶绿体可能是细胞的组成部分，不是原材料，与题干逻辑关系不一致，排除；
C 项：乌贼不是墨汁的原材料，与题干逻辑关系不一致，排除；
D 项：棉花是布鞋的原材料，与题干逻辑关系一致，当选。
故正确答案为 D。