【正确答案】 A

【答案解析】A项当选。过境通行制度是指专为在连接公海或专属经济区一个部分与公海或专属经济区另一部分的海峡继续不停和迅速过境的目的而行使航行和飞越自由。
B项不选。若海峡是由海峡沿岸的一个岛屿和该国大陆形成，而且该岛屿向海一面有在航行和水文特征方面同样方便的一条穿过公海或者专属经济区的航道，则该海峡适用无害通过制度。
C项不选。若国际海峡中有公海或专属经济区的航道，仅在该航道内航行的区域适用公海自由通行制度。
D项不选。如果有专门针对某国际海峡缔结的国际条约，则海峡的通行制度遵循条约的约定，如黑海海峡、麦哲伦海峡等就适用各自专门条约所规定的制度。
故本题选A。