光合磷酸化：由光照引起的电子传递与磷酸化作用相偶联而生成ATP的过程。

氧化磷酸化：由物质在体内氧化时释放的能量供给ADP与无机磷合成ATP的偶联反应。

1）氧化磷酸化发生在线粒体的内膜上；光合磷酸化发生在叶绿体的类囊体膜上；

2）氧化磷酸化为2对H^{+泵到膜间隙，2个H+}3次穿过ATP合成酶形成1分子ATP；光合磷酸化是3对H^{+泵到基质中，3个H+}2次穿过ATP合成酶形成1分子ATP。

3）需要的条件不同：氧化磷酸化不需要光；光合磷酸化需要光；

4）类型不同：氧化磷酸化，光合磷酸化有环式和非环式两种。氧化磷酸化是电子从NADH和FADH2经过电子传递链传给氧形成水，这个过程偶联着ADP磷酸化生成ATP；光合磷酸化是在光的作用下，电子传递和光合磷酸化偶联着ATP的生成。

5）二者利用的能量不同，光合磷酸化利用光能合成ATP，是通过光合作用实现的；氧化磷酸化利用有机物氧化分解所释放的化学能合成ATP，是通过呼吸作用实现的；

6）氧化磷酸化利用氧气氧化[H]生成了水；而光合磷酸化正好相反，利用光能分解水生成了氧气和[H]；

7）所使用的电子传递链和辅酶不同。