本题考查的是沙眼的发生部位。

沙眼衣原体主要侵犯睑结膜，可有充血及血管模糊、乳头肥大、滤泡增生、角膜血管翳、最后以瘢痕形成而告终。

A项错误，球结膜已发生充血，不是沙眼的好发部位。

B项错误，角膜是眼球壁外层前部的透明部分。呈圆形，占外层面积的六分之一，约1毫米厚，主要由无血管的结缔组织构成，不是沙眼的好发部位。

C项正确，沙眼是由沙眼衣原体感染引起的一种慢性传染性疾病，沙眼衣原体主要侵犯睑结膜。

D项错误，眼睑的睑结膜是沙眼衣原体主要侵犯的部位。不是全部眼睑。与题干不符，排除。

故正确答案为C。