【正确答案】 D

【答案解析】民事法律关系的双方主体或者多方主体的法律地位是平等的，因此主体之间法律地位不平等的社会关系不是民事法律关系。在本题中，A、B、C选项中的某市人民政府、税务机关以及国家知识产权局均为行政机关，所涉事项也是履行行政职责，与行政相对人的法律地位并不平等，与之相反，D选项中的某国有企业虽然经济实力更强，但是在交易中，法律地位并无二致，其与丁所签订的专利实施许可协议属于民事法律关系，因而，A、B、C选项不符合题意，D选项符合题意。