发行公司债券支付的手续费计入负债的初始入账金额，选项A错误；甲公司的丁公司债券投资作为可供出售金融资产核算，而购买可供出售金融资产时支付的手续费应计入初始入账价值，选项B正确；购买乙公司股权时发生的交易费用直接计入当期损益，选项C正确，选项E错误；为购买丙公司股权发行普通股时支付的佣金及手续费冲减“资本公积—股本溢价”，选项D错误。