【正确答案】 D

【答案解析】[解析] A选项构成非法制造、运输、储存、邮寄枪支、爆炸物罪。B选项构成重大责任事故罪。C选项罪名由非法拘禁罪转化为故意伤害或故意杀人罪。以上三项均为一罪，不实行数罪并罚。D选项构成强奸罪和故意杀人罪，实行数罪并罚。据此，答案为D。