【正确答案】 D

【答案解析】[解析] 环境水文地质问题调查的主要内容包括三类：a)原生环境水文地质问题；b)地下水开采过程中引起的水文地质问题；c)与地下水有关的其他人类活动情况调查。天然劣质水分布状况属于原生环境水文地质问题，其他三个选项是水文地质条件调查的内容，而不属于环境水文地质问题调查的主要内容。