| 膜或区室 | 线 粒 体 | 叶 绿 体 |
| 外膜 | 标志酶:单胺氧化酶 | |
| 膜厚6nm,通透性强, | 膜厚7nm,通透性强, | |
| 内膜 | 标志酶:细胞色素氧化酶 | |
| 蛋白质:脂质=0.7:0.3 | 蛋白质:脂质=0.9:1 | |
| 通透性差 | 通透性差 | |
| 内折成嵴 | 内折成管状或小泡状 | |
| 内表面有F0-F1 ATP酶复合体 | 内表面光滑 | |
| 有各种类型的运输蛋白 | 仅含运输交换蛋白 | |
| 是电子传递和氧化磷酸化部位 | 是脂合成的部位 | |
| 类囊体膜 | 无 | 外表面有CF0-F1 ATP酶复合体 |
| 光合磷酸化部位 | ||
| 膜间隙 | 标志酶:腺苷酸激酶 | |
| 建立H+梯度 | ||
| 基质 | 含有各种酶系、mtDNA、核糖体、tRNA等与蛋白 质合成相关的成分 | 含有一些酶、chDNA、核糖体、tRNA等与蛋白质合 成相关的成分 |
| TCA循环的场所 | 卡尔文循环的场所 | |
| 类囊体腔 | 无 | 建立H+梯度 |
| 水的光解 |