【正确答案】 B、C、D

【答案解析】 选项B：货物运输合同的计税依据为运输费金额(即运费收入)，不包括所运货物的金额、装卸费和保险费等。选项C：对技术开发合同，只就合同所载的报酬金额计税，研究开发经费不作为计税依据。选项D：已税合同修改后减少金额的，不得申请退税。