本题考查刑法常识。根据《刑法》第六条的规定：“凡在中华人民共和国领域内犯罪的，除法律有特别规定的以外，都适用本法。凡在中华人民共和国船舶或者航空器内犯罪的，也适用本法。犯罪的行为或者结果有一项发生在中华人民共和国领域内的，就认为是在中华人民共和国领域内犯罪。”

A项正确，在我国航空器内犯罪的，适用我国刑法。美国公民甲在我国航空器内杀害了我国公民乙，适用我国刑法。

B项错误，不适用我国《刑法》管辖。

C项错误，根据《中华人民共和国香港特别行政区基本法》第二条规定：“全国人民代表大会授权香港特别行政区依照本法的规定实行高度自治，享有行政管理权、立法权、独立的司法权和终审权。”香港特别行政区具有独立的司法权，中国公民甲在香港机场杀害英国公民乙，应当适用香港的刑事法律。

D项错误，旅行大巴不属于船舶或者航空器，应属于保护管辖。

故正确答案为A。