【正确答案】(1)PCR反应的缓冲液:
三羟甲基氨基甲烷.盐酸(Tris-HCl)缓冲液
氯化钾(KCl)促进引物的退火,浓度太高时会抑制Taq DNA聚合酶活性。
加入BSA或明胶有利于保护Taq DNA聚合酶活性。
必要时加入适量二甲基亚砜(DMSO)或甲酰胺利于破坏模板二级结构,提高PCR反应特异性。
(2)镁离子浓度:一般用量1.5~2.0mmoL/L,Taq DNA聚合酶活性需要Mg2+。Mg2+浓度过低,会显著降低酶活性。Mg2+浓度过高又使酶催化非特异性扩增增强。Mg2+浓度还会影响引物的退火、模板与PCR产物的解链温度,从而影响扩增片段的产率。
(3)底物浓度:工作浓度20~200μmol/L,dNTPs浓度过高可加快反应速度,也增加碱基的错配率和实验成本。降低浓度会导致反应速度下降,可提高反应的特异性。在PCR反应中,4种dNTP必须以等摩尔浓度配制,以减少PCR反应的错配误差并提高使用效率。
(4)Taq DNA聚合酶:75℃~80℃时具有最高的聚合酶活性,150个核苷酸/s;具有良好的热稳定性,95℃仍有活性,应用浓度一般为1~2.5U/100μL反应体积。
(5)引物0.1~0.5μmol/L:引物浓度偏高会引起错配或非特异性扩增、生成引物二聚体,使目的DNA片段产率下降。退火温度与引物Tm值有关,引物Tm值在55℃~80℃范围较为理想。
(6)反应温度和循环次数。
【答案解析】