在财务报表审计中，注册会计师应当了解被审计单位及其环境，包括了解内部控制(选项A正确)；注册会计师了解内部控制包括评价内部控制的设计(选项C正确)和确定相关控制活动是否得到执行(选项D正确)；注册会计师不需要了解内部控制的所有方面，不需要专门查找内部控制运行中的所有缺陷(选项B错误)。