出现评估结果差异的原因可能有：
①评估目的不同
资产评估的特定目的指的是被评估资产即将发生的经济行为。同样的资产，因为评估的特定目的不同其评估价值也不相同。资产评估的特定目的对资产评估的影响表现在两个方面：一是在什么样的条件下，即资产发生怎样的经济行为时应该评估和可以评估；二是不同的经济行为决定了评估价值类型的差异，引致资产评估结果的差异。
在本案例中，第一家评估事务所是欲经营转型的企业聘请的，对其下一个子公司进行评估，其评估目的为企业转让；第二家评估事务所是有收购意向的公司聘请的，其评估目的为企业收购。这两家评估事务所都是对相同的一个公司进行评估，但评估目的有所不同，因此，最终的评估结果也就存在着差异。
②价值类型不同
资产评估价值是某项资产在特定条件下的价值表现，其价值涵义不同，结果也不一样。价值类型是指评估价值的类别，是每一项评估价值的具体价值尺度。一般而言，评估特定目的不同，选用的价值类型也不一样，从而最终评估结果也就不同。
在本案例中，第一家评估事务所在评估中确定的评估目的为企业转让，因此，应选择市场价值作为评估的价值类型，即自愿买方和自愿卖方，在评估基准日进行正常的市场营销之后所达成的公平交易中，该子公司应当进行交易的价值估计数额。第二家评估事务所在评估中确定的评估目的为企业收购，因此，应选择投资价值作为评估的价值类型，即该子公司对于具有明确投资目标的特定投资者所具有的价值。在价值类型的选择上的差异，也会导致最终评估结果的不同。
③评估方法不同
评估方法是指评估价值估算的思路，主要有三种基本的评估方法：成本法、市场法和收益法。在同一资产的评估中可以采用多种方法，如果使用这些方法的前提条件同时具备，包括市场的有效性，而且评估师也具备相应的专业判断能力，那么，多种方法所得出的结果应该趋同。但在实际操作中，市场条件、资产的状态等会存在一定的缺陷，从而导致不同评估方法得到的评估值并不相同。

出现这种情况是由于委托方没有正确理解资产评估所具有的公正性和咨询性的特点。
①公正性
公正性是指资产评估行为对于评估当事人具有独立性，它服务于资产业务的需要，而不是服务于相互矛盾的资产业务当事人任何一方的需要。公正性的表现有两点：一是资产评估是按公允、法定的准则和规程进行的，具有公允的行为规范和业务规范，这是公正性的技术基础；二是评估人员通常是与资产业务没有利害关系的第三者，这是公正性的组织基础。
②咨询性
咨询性是指资产评估结论是为资产业务提供的专业化评估意见，这个意见本身并无强制执行的效力，评估者只对结论本身合乎职业规范要求负责，而不对资产业务定价决策负责。事实上，资产评估为资产交易提供的估价往往由当事人作为要价和出价的参考，最终的成交价格取决于讨价还价的本领。