【正确答案】研究者从基因调控网络等有向网络中发现了一些特殊的模序,比较重要的有自调控环、前馈环和单输入模序等。
自调控环模序包括正向自调控环和负向自调控环,即转录因子促进或抑制自身转录的机制。在大肠埃希菌(E.Coli)基因调控网络中存在较多的自调控模序。
前馈环模序则是在很多物种中常见的一种调控机制,即转录因子A调控转录因子B和基因C,而同时转录因子B也调控基因C。事实上,由于调控机制本身可以为正向和负向,前馈环还可以分为8种不同的类型。出现频率较多的有两种,一种是全部正向调控的一致前馈环,另一种是A正向调控B和C,但B负向调控C的不一致前馈环。
单输入模序由同一个转录因子同时调控多个基因的表达,转录因子通常是自调控的,而所有调控符号(正、负向)都相同,且受控基因都不再受其他因子调控。这种模块在随机网络中并不多见,但在针对大肠埃希菌基因调控网络的分析中发现该模块经常出现在与蛋白质组装和代谢通路相关的基因调控中。在此类问题中,由一个转录因子控制参与生物过程基因的表达,能够有效地保持受控基因的比例,提高效率。
【答案解析】