因房企搁置三年未动工建设，依据相关规定，超过未动工的，政府可收回土地，城乡规划主管部门履行程序如下：
1.依法收回相关规划许可。
2.修改控规。规划局对控规修改的必要性进行论证，征求利害关系人 的意见，向市政府提出专题报告，经市政府批准后"，组织编制新控 规。
3.委托单位。规划局应委托具有相应资质等级的单位承担规划的具体 编制工作。
4.公示。规划局在新控规报批前，应将规划草案进行公示，并采取论 证会等形式听取专家和公众意见，公告时间不得少于 30 日。
5.报批。规划局将修改完成后的控规报市政府审批，并向市人大常委 会和上一级人民政府备案，报送审批时，专家和公众的意见和对意见 的采纳情况及理由一并报送。
6.确定规划条件。在该国有土地使用权出让前，依据修改后的控规， 提出用地位置、面积、使用性质、开发强度等规划条件，作为国有土 地使用权出让合同的组成部分。
7.土地依法出让后，城乡规划主管部门应依法核发建设用地规划许可 证和建设工程规划许可证，待项目实施后，依法组织规划验收。