【正确答案】 B

【答案解析】根据《公务员法》第95条的规定，机关根据工作需要，经省级以上公务员主管部门批准，可以对专业性较强的职位和辅助性职位实行聘任制，但是职位涉及国家秘密的，不实行聘任制。据此保密局不能聘任负责保密工作的计算机程序员，A选项错误。根据《公务员法》第98条第3款规定，“聘任制公务员按照国家规定实行协议工资制”B选项正确。根据《公务员法》第98条第2款规定，“聘任合同期限为一年至五年”，据此C选项错误。《公务员法》中没有规定聘任公务员的合同须经上级机关批准，D选项错误。