核糖体上具有一系列与蛋白质合成有关的结合位点与催化位点及功能如下：

（1）与mRNA结合的位点：蛋白质的起始合成首先需要mRNA与小亚基结合。原核生物中，核糖体与mRNA的结合位点位于l6SrRNA的3＇端，其准确识别的基础是细菌mRNA有一段特殊的Shine-DalgarnO序列（SD序列），位于起始密码子上游5～10bp处。SD序列能与核

糖体小亚基16SrRNA的3＇端序列互补结合。真核生物没有SD序列，核糖体小亚基准确识别mRNA的基础主要依赖于mRNA5＇端的甲基化帽子结构。

（2）A位点：与新掺入的氨酰-tRNA结合的位点—氨酰基位点。

（3）P位点：与延伸中的肽酰-tRNA结合的位点—肽酰基位点。

（4）E位点：与脱氨酰-tRNA的离开—A位点到完全释放的一个位点。

（5）延伸因子结合位点：与肽酰-tRNA从A位点转移到P位点有关的转移酶（即延伸因子EF-G）的结合位点。

（6）肽酰转移酶的催化位点：是核糖体中最主要的活性部位。

此外还有与蛋白质合成有关的其他起始因子、延伸因子和终止因子的结合位点。