| 核酸酶 | 底物 | 切点 | 产物 |
| 胰核糖核酸酶 | RNA | 内切核酸酶嘧啶3'端, 留下3'-P | 3'-嘧啶单核苷酸或 3'-P嘧啶的寡聚核苷酸 |
| 蛇毒磷酸二酯酶 | RNA DNA | 外切核酸酶3'端, 留下3'-OH | 5'-单核苷酸 |
| 牛脾磷酸二酯酶 | RNA DNA | 外切核酸酶5'端, 留下5'-OH | 3'-单核苷酸 |
| 大肠杆菌核酸 外切酶Ⅰ | 单链 DNA | 外切核酸酶5'端, 留下5'-OH | 3'-单核苷酸 及一个末尾二核苷酸 |
| 大肠杆菌核 酸外切酶Ⅲ | 双链 DNA | 外切核酸酶3'端, 留下3'-OH | 5'-单核苷酸 |