【正确答案】 B、C

【答案解析】 选项A错误。根据国际法现行有效的国家主权绝对豁免制度，国家享有管辖豁免权，即非经一国同意，国家的行为及其财产不受或免受他国法院管辖。一国驻外使馆属于该国国家机关，其行为归因于国家，因此对于甲国公司与乙国驻甲国使馆之间的纠纷，乙国法院原则上没有管辖权，除非甲国对自己的主权豁免进行了放弃。国家主权豁免放弃包括明示放弃和默示放弃两种，其中默示放弃是指国家通过在外国法院的与特定诉讼直接有关的积极的行为表示其放弃豁免而接受法院管辖。合同中有适用甲国法律的条款与主权豁免的放弃没有任何关系。
   选项BC正确。国家主权豁免放弃包括明示放弃和默示放弃两种，其中默示放弃是指国家通过在外国法院的与特定诉讼直接有关的积极的行为表示其放弃豁免而接受法院管辖，包括国家作为原告在外国法院提起诉讼、正式出庭应诉、提起反诉或作为利害关系人介入特定诉讼等。派代表出庭主张豁免不代表默示放弃管辖豁免，但提起反诉属于豁免权的默示放弃方式之一。
   选项D错误。放弃主权豁免必须满足自愿、特定和明确的要求，放弃的意思表示必须是针对某一特定案件作出，因此乙国曾接受过甲国法院的管辖，不意味着甲国法院有权管辖其他涉及乙国的案件。