【正确答案】 A、B、E

【答案解析】商标注册申请实质审查包括禁止性条款审查、与他人在先商标相同或近似的审查。禁止性规定的审查，是审查注册申请是否违反《商标法》禁止注册或使用的规定。法律依据主要包括：《商标法》第四条(不以使用为目的的恶意商标注册申请)；第十条(不得作为商标使用的标志)；第十一条(缺乏显著性的标志)；第十二条(缺乏显著特征的三维标志)；第十九条第四款(商标代理机构不得申请注册的商标)。