本题考查中国特色社会主义理论体系。

题干中，国务院办公厅通过印发《关于加强传染病防治人员安全防护的意见》，从政策上保护了一线防治工作人员，切实维护了医护人员的健康权益。

A项错误，从群众中来到群众中去，是中国共产党群众路线的领导方法和工作方法，是党制定方针政策要广泛地、反复地征求和听取各方面群众意见的工作方法，与题目无关。

B项错误，人民当家作主是社会主义民主政治的本质要求，是指人民群众合法、负责、理性、有序地参与国家和社会管理，题干并未涉及。

C项正确，中国共产党始终代表中国最广大人民的根本利益，政府印发保护一线传染病防治人员的《意见》，真正从政策上保护了传染病医护人员的健康权利，保护了人民的根本利益。

D项错误，党的思想路线是一切从实际出发，理论联系实际，实事求是，在实践中检验和发展真理，题干中没有政府根据实际做决策的相关描述，为无关项。

故正确答案为C。