【正确答案】 A

【答案解析】 公司登记制度是指将公司的一些基本信息按照法定程序，在公司登记机关备案，以供公众查阅的制度。设立公司登记制度，旨在巩固公司信用并保障交易安全。我国的公司登记主要有三种类型：(1)设立登记。公司经设立登记，取得法人资格、从事经营活动的合法身份和公司名称的专用权。(2)变更登记。公司存续期间，就公司登记事项中某一项或者几项在公司登记机关的备案中加以更改，否则不得对抗善意第三人。(3)注销登记。公司经注销登记法人人格消灭。兼并登记并不是法定的登记种类，因而，B项错误。
   本题中，甲有限责任公司与甲股份有限公司虽然字号相同，但是却是两个相互独立的主体，甲股份有限公司是新设立的公司，应当进行设立登记，因此A项正确。