（1） 当前土地管理工作存在的问题
①存在着职能重叠、 政出多门的现象
传统的二元经济格局， 导致了土地利用和管理人为割裂， 城乡地政缺乏统一管理。 城乡土地市场尤其是对城市土地二级市场的管理， 存在着职能重叠、 政出多门的现象。 其管理主体除土地管理局外， 还有房地产、 城市建设委员会， 城市规划局等平行机构， 各部门各自为政， 均从部门的角度来管理土地， 是城市土地利用集约度较低，城区面积过度扩张的主要原因之一。
②基层土地管理， 尤其是乡级土地管理组织薄弱
乡镇土地管理所是土地行政执行机构， 也是中国最基层的土地行政管理机构， 除依法贯彻党和国家有关土地的方针、 政策之外， 还肩负有协助县土地管理部门进行乡镇土地规划、 地籍调查， 协助其他部门处理土地纠纷等职责， 其作用和地位十分重要。 目前， 我国乡镇级土地管理机构设置和乡镇土管人员的配置与其作用和地位不相称， 也与深化土地使用制度改革， 建立社会主义市场经济体制的要求不相适宜。 主要体现在：
a． 乡镇土地管理机构设置不够完善， 部分乡镇没有设置土地管理的专门机构；
b． 乡镇土地管理人员专业素质有待提高， 极大地影响乡镇级土地管理功能的发挥；
c． 乡镇土地管理机构职责与其土地管理权限不协调。
③土地管理部门进行土地执法与监督容易受到地方利益干扰
土地管理机关是政府重要的职能部门， 履行土地事务管理的职责， 它代表政府行使土地管理的权责。 因此它只能在政府授权范围内依法行政， 即它的职责来自于政府授权， 其土地行政行为都要受到政府的干预和制约。 如地方政府为引进更多外资， 鼓励本区域内非农产业的发展， 往往会采取以土地换资金的方式， 将土地低偿或无偿出让或划拨给企业， 或在政府自己设立开发区的地区将土地转变为非农用地。
2） 土地管理体制改革的方向
①如何转变政府职能， 克服土地管理中存在的体制、 机制和法制不健全的问题；
②如何精简机构， 提高依法行政和有效行政的水平， 提高行政管理效率；
③如何实行土地用途管制， 处理好耕地保护和建设用地保障供给的关系， 促进土地资源优化配置和土地收益公平合理分配。
（3） 对于我国现行土地管理体制改革的建议
①建立土地垂直管理的府级关系
加强中央政府宏观控制能力， 提高地方政府积极性与决策能力， 形成土地垂直管理的府级关系。 即， 中央政府应重在立法层面， 完善土地管理的法律法规体系； 在统筹全国土地资源及其功能分布的基础上， 科学规划主体功能区与土地发展权（特别是农地发展权）， 建立地方政府科学执行土地利用规划的“标杆”； 变革区域政策， 重构绩效评价与考核体系， 协调地方政府之间矛盾与冲突； 坚决退出土地微观管理事务， 切实赋予地方政府土地利用的执行权， 充分发挥其智慧、 调动其积极性。 地方政府应坚持以贯彻执行中央政策为主责， 统筹全省土地资源利用规划， 严格执行中央核定的指标以及主体功能区与土地发展权规划， 落实中央制定的产业发展布局与国民经济发展规划， 积极弥补法律法规体系、 产业与经济发展规划等方面的缺陷。
②建立健全土地法律法规体系
中央政府应制定《土地法》 等基本法律， 完善土地资源管理的法律法规体系， 明确界定土地违法行为及其责任， 建立严格的追惩责任制， 避免违法收益大于其成本与风险， 消除土地违法动机， 构建保护耕地、 抵御地方政府土地违法的制度屏障， 使土地管理的各项工作有法可依、 依法追惩， 使土地管理走上法制化道路。
③改革利益分配机制
中央政府应依据土地资源在社会生活、 国民经济和国家安全中的重要性， 考虑土地所有权、 使用权和管理权的利益， 调整土地所有权出让收益分配， 建立科学的利益分配机制， 统一事权与财权， 以加大中央所占比例、 降低地方政府所占比例， 切断利益驱动的根源， 调整和完善土地垂直管理体制， 明确中央政府与地方政府等各主体的权利、 利益、 责任关系， 建立健全土地管理的长效机制。
④建立土地安全保障基金
为了保障土地的安全， 特别是耕地安全， 提高土地利用效率， 政府应建立土地安全保障基金， 用于生态环境恶化、 自然灾害对土地毁损的修复， 用于非农建设用地的修复， 用于非农建设用地占用耕地的补偿（购买农地发展权） 以及土地整理等。