【正确答案】 A、C

【答案解析】当事人向两个以上有管辖权的管理专利工作的部门提出请求的，由最先受理的管辖，选项A正确。管理专利工作的部门之间发生管辖权争议的，由其共同上级部门指定管辖；无共同上级部门的，由国务院专利行政部门指定管辖，而不是由国务院专利行政部门管辖，选项B错误。对跨区域侵犯权利人的同一专利权的案件，权利人可以请求各管理专利工作的部门的上级部门处理，选项C正确。国务院专利行政部门可以应专利权人或者利害关系人的请求处理在全国有重大影响的专利侵权纠纷，而不是主动处理，选项D错误。