甲、乙两个企业2018年投入的研发经费之和总计占收入之和的12%，其中甲企业的收入是乙企业的2倍，投入的研发经费比乙企业多50%，如甲、乙企业投入的研发经费占各自收入的比重分别为x%和y%，则有：
第一步，本题考查基础应用题。 第二步，赋乙企业的收入为1，则甲企业为2，则有2x+y=12(x+y)，2x=(1+50%)y，解得x=10.8,y=14.4。则x-y=-3.6。 因此，选择B选项。