PPI通常在酸性条件下比较稳定；PPI的半衰期短，但是由于作用于H⁺,K⁺-ATP酶胃酸分泌的最后环节，作用时间较长；与其他药物相互作用较少的是泮托拉唑和非酶代谢的雷贝拉唑；PPI代谢涉及的肝药酶包括CYP3A4和CYP2C19两种。