泌尿系感染途径有：上行感染、血行感染、直接感染及淋巴道感染。最常见的是上行感染和血行感染。其中，病原菌经由尿道上行至膀胱，甚至输尿管、肾盂引起的感染称为上行感染，约占尿路感染的95％，以大肠杆菌为主。病原菌通过血运到达肾脏和尿路其他部位引起的感染称为血行感染，以金黄色葡萄球菌为主。