我国主要应用生态工程技术、优良的传统农作技术及系统工程的最优化方法，并辅以相应的配套技术，对农业生态系统的不同层次进行设计和管理，提出分层多级利用资源的生产工艺系统。生态工程的目标就是在促进物质的良性循环前提下，充分发挥资源的生产潜力，防止环境污染，达到经济与生态效益同步发展。生态农业的主要技术包括以下几个方面。

（1）立体种植与立体种养技术

立体种养技术主要通过协调作物与作物、作物与动物以及农业生物与环境之间的复杂关系，充分利用互补机制并尽量避免竞争，使各种农作物和动物能够各得其所、和谐共处，以提高资源利用效率及生产效率。这类模式在我国农区相当普遍，尤其是在光、热、水资源条件较好、生产水平较高的地区更是类型多样，成为解决人多地少、增产增收的主要途径。

（2）有机物质多层次利用技术

物质多层次、多途径循环利用是生态农业中最具代表性的技术手段。其技术主要通过种植业、养殖业的动植物种群、食物链及生产加工链的组装优化加以实现。

（3）生物防治病、虫、草害技术

通过引入天敌来治理害虫。

（4）再生能源开发技术

开发利用生物能、自然能等新能源，替代部分化学工业能。

（5）生物措施与工程措施配合

水土流失和土壤侵蚀是影响我国农业发展和引起环境变劣的重要原因。实施生物措施与工程措施相结合的综合治理技术，能显著改善生态环境，也是控制水土流失的有效技术。盐碱地、沙荒地等的改造治理，也需要工程措施和生物措施相结合，如通过种植抗盐、养地的牧草、作物，结合开沟排盐、挖渠引水等工程措施，能有效改良盐碱地或沙荒地。