【正确答案】 D

【答案解析】[解析] 根据《刑事诉讼法》第30条第1款规定：“审判人员、检察人员、侦查人员的回避，应当分别由院长、检察长、公安机关负责人决定；院长的回避，由本院审判委员会决定；检察长和公安机关负责人的回避，由同级人民检察院检察委员会决定。”以及《刑事诉讼法》第31条第1款规定：“本章关于回避的规定适用于书记员、翻译人员和鉴定人。”所以对书记员、翻译人员和鉴定人的回避事宜，从提出申请或者请求到决定程序，均适用《刑事诉讼法》第28～30条的规定，分别由他们各自履行职责或者聘请、指派他们的机关负责人即公安机关负责人、检察长、院长决定是否回避。本题中祝某虽然是某检察机关的鉴定人，但却是由人民法院聘请担任该案鉴定人，因此应由聘请他的机关负责人即法院院长作出回避决定。故本题的正确答案为D。